Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA18Q8TC71 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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SPATA18Q8TC71 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA18Q8TC71 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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