Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms