Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms