Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms