Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms