Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH13Q8NBN7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH13Q8NBN7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms