Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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CLDN19Q8N6F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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