Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KSR1Q8IVT5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms