Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APRG1Q8IVJ8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms