Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR49Q8IV35 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms