Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL1Q8IU54 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL1Q8IU54 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms