Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS37DQ86XT2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms