Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP13Q86W25 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms