Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA8AQ86V59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8AQ86V59 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms