Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRX1Q86UT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms