Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT25Q7Z3Z0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT25Q7Z3Z0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms