Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP1Q7RTM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms