Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC80Q76M96 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms