Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms