Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms