Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3FQ6ZSY5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3FQ6ZSY5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms