Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VSTM1Q6UX27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSTM1Q6UX27 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms