Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms