Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSSK4Q6SA08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms