Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ATAD2Q6PL18 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms