Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms