Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms