Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms