Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms