Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms