Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms