Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms