Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms