Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP170Q5SW79 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms