Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms