Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms