Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms