Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC1Q4ZHG4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms