Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVEP1Q4LDE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms