Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms