Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms