Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
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FOXD1Q16676 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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FOXD1Q16676 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
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