Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms