Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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