Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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