Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD2Q16342 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD2Q16342 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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