Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC1Q15915 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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