Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZFHX3Q15911 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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