Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L2Q15782 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CHI3L2Q15782 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CHI3L2Q15782 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CHI3L2Q15782 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CHI3L2Q15782 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CHI3L2Q15782 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L2Q15782 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms