Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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